Цефамезин одатда тавсия этилган дозаларда қўлланганида, организм томонидан жуда яхши ўзлаштирилади.
Қўллаш тартибига риоя қилинмаганида ёки доза ошириб юборилганида қуйидаги ножўя таъсирлари кузатилиши мумкин: Овқат ҳазм қилиш тизими томонидан: кўнгил айниши, қусиш, ич кетиши ёки қабзият, метеоризм, қорин оғриғи, дисбактериоз, меъда-ичак йўлларининг кандидомикози (шу жумладан кандидозли стоматит), жигар фаолиятини бузилиши (ишқорий фосфатазалар, жигар трансаминазалари фаоллигини ошиши, гипербилирубинемия), кам ҳолларда – стоматит, глоссит, сохтамембраноз энтероколит.
Аллергик реакциялар: эшакеми, этни увишиши, иситма, тошмалар, қичишиш, кам ҳолларда – бронхоспазм, эозинофилия, кўпшаклли экссудатив эритема, ангионевротик шиш, анафилактик шок.
Қон яратиш аъзолари томонидан: лейкопения, нейтропения, гранулоцитопения, тромбоцитопения, гемолитик анемия, гематокритни пасайиши, протромбин вақтини узайиши.
Сийдик-жинсий тизими томонидан: буйраклар фаолиятини бузилиши (азотемия, қондаги мочевина миқдорининг ошиши, гиперкреатининемия).
Маҳаллий реакциялар: флебит, вена йўли бўйлаб оғриқ, мушак ичига юборилган жойда оғриқ ва инфилтрат.
Бошқалар: суперинфекция, кандидамикоз.